Sprawom dotyczącym podziału terytoriów napoleońskich poświęcono na kongresie najwięcej uwagi. Najwięcej kontrowersji było wokół Saksonii. Prusy były gotowe zrzec się swoich terytoriów na rzecz saksońskich. Uznano jednak, że złamałoby to zasadę równowagi i przydzielono Prusom dwie piąte terytorium Saksonii. Prusom przydzielono również Pomorze Gdańskie, miasta Gdańsk i Toruń oraz zachodnią część Księstwa Warszawskiego.
