Mezenchyma występuje u najprymitywniejszych zwierząt trójwarstwowych, na przykład u płazińców i nicieni. W innym wypadku mezoderma może się tworzyć ze specjalnych, wydzielonych komórek (tak zwanych prakomórek mezodermalnych).
Zygota przechodzi przez proces bruzdkowania, dzieli się mitotycznie najpierw na dwie komórki potomne, zwane blastomerami. Następnie wzdłuż tej samej osi dzieli się na cztery komórki, potem poprzecznie do poprzednich podziałów na 8 blastomerów, potem na 16, 32 itd., aż do powstania wielokomórkowej, pełnej w środku grudki komórek zwanej morulą. Bruzdkowanie przebiega różnie, w zależności od zasobności komórki jajowej w żółtko. Można założyć, że odpowiada etapowi kolonii w naszej schematycznej filogenezie zwierząt.
