Na obszarze Niziny Amazonki znajduje się rzeka o największym dorzeczu na Ziemi - Amazonka. Stanowi ona 20% zasobów wody słodkiej na Ziemi. Rzeka ta posiada ponad 200 dopływów, które w rezultacie tworzą rozległy system rzeczny. Do największych z nich zaliczamy np. Purus, Negro, Madeira uznawane również za najbardziej meandrujące rzeki na Ziemi.