Po wykształceniu się mezodermy rozpoczyna się proces kształtowania narządów, czyli organogeneza, będąca ostatnim etapem rozwoju zarodkowego. Z poszczególnych listków zarodkowych u trójwarstwowców tworzą się zazwyczaj te same struktury organizmu. Rozwój zarodkowy kończy się wykluciem z osłon jajowych lub porodem. Wykluwanie się młodego osobnika zachodzi u zwierząt jajorodnych, czyli takich, które składają jaja poza obrębem organizmu rodzicielskiego. Poród ma miejsce w przypadku zwierząt jajożyworodnych i żyworodnych.