Cząsteczka amoniaku ma kształt tzw. piramidy trygonalnej. Atom azotu wykazuje hybrydyzację sp3. Trzy z powstałych orbitali tworzą wiązania z atomami wodoru, czwarty jest zajmowany przez wolną parę elektronową. Obecność wolnej pary elektronowej powoduje odpychanie elektronów tworzących wiązania N-H, przez co kąt między tymi wiązaniami jest nieco mniejszy (wynosi 106°45') niż np. między wiązaniami C-H w metanie (109°28'). Z powodu stosunkowo dużej różnicy elektroujemności (0,84 wg Paulinga) cząsteczka amoniaku ma dość duży moment dipolowy (μ=1,46 D). Polarność cząsteczek amoniaku jest przyczyną tworzenia się między nimi wiązań wodorowych.
Właściwości fizyczne
W warunkach normalnych amoniak jest bezbarwnym gazem
Zapach – charakterystyczny ostry
Rozpuszczalność – bardzo dobrze rozpuszczalny w wodzie
Gęstość (w. normalne) - 0,771 g/dm3
Temperatura wrzenia – (-33,3 °C) (Ciekły amoniak wykazuje wiele podobieństw do wody - analogicznie do niej autodysocjuje)