Wody znajdujące się na obszarze Himalajów należa do zlewiska Oceanu Indyjskiego. W północnej części himalajów swój początek biorą rzeki, które kierują się na południe. Rzeki, które pojawiły sie znacznie wcześniej od gór w trakcie wypiętrzania się i powstawania Himalajów pogłębiały swoje koryta. Największe rzeki tego obszaru to: Indus, Brahmaputra, Ganges, Satledź, Mekong. Koryta tych rzek są wąskie ale za to bardzo głęboki, często płyną one przez doliny o dużym spadku i licznymi progami. Stan wód w Himalajach ulega dużym wahaniom w ciągu roku a w szczególności w okresie letnim.