Gdy
elektrony wędrują za pomocą łańcuchów przenośników, dochodzi do przeniesienia
jonów wodorowych ze
stromy do wnętrza kanału
tylakoidu. Wówczas po wewnętrznej stronie błony tylakoidu panuje nadmiar
protonów, a po zewnętrznej – niedobór. Brak elektronów jest uzupełniane bezpośrednio z wody przez
utlenione centrum
fotosystemu II. Następnie proces rozpadu wody, który prowadzi do powstania O
2, 2H
+ oraz dwóch elektronów. Zjawisko to nazywa się
fotolizą, ponieważ zachodzi w świetle, więc tlen jest jej produktem, który jest następnie uwalniany do atmosfery. Tak więc elektrony z
fotosystemu I wędrują do
NADP+, a z fotosystemu II do
PSI, natomiast elektrony z wody wędrują do
PSII. Nazywa się to
niecyklicznym transportem elektronów.