Karol Iwysłał do Londynu wojsko, które początkowo odnosiło sukcesy. Purytanie zdołali jednak zorganizować armię, która składała się ze średniej szlachty i mieszczaństwa z Oliverem Cromwellem na czele. W 1645 r. rozbiła ona armię króla pod Naseby, a Karol I uciekł do Szkocji. Prezbiterianie zaniepokojeni rozwojem rewolucji postanowili porozumieć się z królem. Jednak Cromwell przeprowadził czystkę w Izbie Gminn, pozostawiając tylko ludzi z opozycji antykrólewskiej.