W wodach jezior i rzek żyją przedstawiciele ichtiofauny: szczupaki, okonie, sandacze, karpie, płocie i leszcze. Największe rozmiary osiągają sumy. W rzekach płynących przez tereny leżące blisko morza bytują ryby dwuśrodowiskowe (trocie, węgorze). W górskich rzekach najbardziej charakterystycznymi gatunkami ichtiofauny są: pstrągi, głowacze, strzeble potokowe, żyjące w wodach o wartkim nurcie. Skład i liczebność ichtiofauny w zbiorniku wodnym można zmieniać przez odłów, zarybianie oraz wypieranie przez gatunki obce, zwłaszcza gatunki inwazyjne lub przez zmiany warunków panujących w zbiornikach wodnych.
Inwentaryzacją ichtiofauny nazywamy sporządzenie wykazu gatunków danego obszaru.