Zawartość komórki bada się poprzez izolowanie jej elementów, do czego służą techniki frakcjonowania (rozdzielanie zawartości komórek). Do tej operacji stosuje się ultrawirówkę (urządzenie wykorzystywane do rozdzielania na frakcje, czyli części), w której na poddawane badaniu próbki działa siła odśrodkowa powstająca dzięki wysokim obrotom w ultrawirówce (kilkadziesiąt tysięcy i więcej obrotów na minutę). Przed frakcjonowaniem należy stworzyć pory w błonie komórkowej (powoduje to uwalnianie białka lub DNA bez zniszczenia komórki) za pomocą detergentów lub przeprowadza się bardzo delikatne rozbijanie komórek. W ten sposób uzyskuje się homogenatem, czyli zawiesinę komórkową.