Oprócz roślin przystosowanie do takich ekstremalnych warunków wytworzyły też zwierzęta takie jak: gazela, dorkas, zagrożony wyginięciem adaks i algazel. Charakterystyczne dla tego obszary dromadery dzisiaj nie są już dziki lecz oswojone i często stanowi transport dla człowieka. Tereny górzyste i skaliste zajmowane są przez stada arui i koziorożców. Prócz zwierząt kopytnych występują również zwierzęta drapieżne: lisek pustynny-fenek, miodożer ratel oraz hiena. Na obszarze Sahary można także spotkać gryzonie takie jak: skoczki egipskie i piaskówki. Bardzo liczne są gady: jaszczurki i węże. Do spotykanych bezkręgowców należą chrząszcze skarabeusze (uważane były za święte) oraz skorpiony.