Istnieją zasadniczo dwie różne grupy
bakterii,
Archaebacteria i
Eubacteria, które tworzą dwa podkrólestwa wśród
Procaryota. Archaebacteria łączą kilka rodzajów prokariontów zdolnych do życia w ekstremalnych warunkach, natomiast na Eubacteria składają się wszystkie pozostałe grupy prokariontów.
Biochemiczne i metaboliczne różnice dzielące te dwie grupy sugerują, że oddzieliły się one od siebie dawno temu – stosunkowo wcześnie w historii
życia. Wiele z pośród ekstremalnych
środowisk, w których żyją współczesne Archaebakterie, przypominają warunki jakie panowały na pierwotnej
Ziemi. Można więc przypuszczać, że Archaebacteria są starą grupą, która do dzisiaj ulegała niewielkim zmianom.
