Na obszarze Syberyjskim występuje klimat umiarkowany chłodny kontynentalny. Występują tutaj krótkie i ciepłe lata oraz długie i bardzo surowe zimy z niewielkimi opadami. Średnia temperatura lipca wynosi od 10°C na północy do 19°C na południu, zaś w styczniu temperatura znajduje się w granicach od -10°C do -50°C z dochodzącą do -60°C temperaturą w śródgórskich kotlinach. Najniższa temperatura wynosząca -77,8°C została zanotowana w okolicy Ojmiakonu. Najwięcej opadów występuje w porach letnich. Roczna suma wynosi 400 mm na Nizinie Zachodniosyberyjskiej, 300 mm na Wyżynie Środkowosyberyjskiej i do 200 mm w północno-wschodniej części regionu.