Twardowski zmarł w 1938 roku, Leśniewski w 1939, wojna zadała szkole lwowsko-warszawskiej olbrzymie straty: życie stracili (wielu było pochodzenia żydowskiego): Blaustein, Blausteinowa, Hosiasson-Lindenbaumowa, Presburger, Salamucha, Schmierer, Auerbach, Wajsberg. Mimo tych strat, szkoła lwowsko-warszawska brała czynny udział w tajnym nauczaniu.
W 1948 zmarł Zawirski, wielu zwolenników szkoły lwowsko-warszawskiej opuściło kraj - tuż przed wojną, w czasie jej trwania lub niedługo po 1945 roku. Należeli do nich: Bocheński, Hiż, Lejewski, Jordan, Łukasiewicz, Poznański, Sobociński, Tarski, Wundheiler.
