Błona śluzowa wyściela ściany przewodu pokarmowego. Błona ta jest tworzona przez
nabłonek walcowaty i leżącą pod nim tkankę łączną. Śluz wydzielany przez komórki gruczołowe nabłonka ma za zadanie ułatwianie przesuwania pokarmu.
Śluzówka żołądka i – w szczególności – jelita jest mocno pofałdowana, a dodatkowo fałdy jelita posiadają
kosmki jelitowe w postaci palczastych wypustków, które są wyposażone w mikrokosmki. Szacuje się, że całkowita powierzchnia
jelita cienkiego wynosi w przybliżeniu 200 m
2. Kolejną warstwą ściany przewodu pokarmowego jest
łącznotkankowa błona podśluzowa, która mieści w sobie liczne nerwy oraz naczynia krwionośne limfatyczne. Podśluzówka jest otoczona błoną mięśniową, która jest zazwyczaj tworzona przez dwie warstwy
mięśni gładkich.