Kwas deoksyrybonukleinowy (dawn. kwas dezoksyrybonukleinowy), w skrócie DNA (od
ang.
Deoxyribonucleic acid) – wielkocząsteczkowy organiczny
związek chemiczny
należący do
kwasów nukleinowych
. Występuje w
chromosomach
i pełni rolę nośnika
informacji genetycznej
organizmów żywych
.
Skład i budowa
DNA jest
liniowym
, nierozgałęzionym
biopolimerem
, dla którego
monomerem
są
nukleotydy
. Nukleotydy zbudowane są z: pięciowęglowego cukru
deoksyrybozy
, którego
grupa hydroksylowa
znajdująca się przy ostatnim atomie węgla jest
zestryfikowana
resztą fosforanową, a pierwszy atom węgla połączony jest
wiązaniem N-glikozydowym
z jedną z czterech
zasad azotowych
:
adeniny
A i
guaniny
G (
zasady purynowe
) oraz
cytozyny
C i
tyminy
T (
zasady pirymidynowe
).
Powszechnie spotykaną modyfikacją DNA jest występowanie 5-metylocytozyny (m5C) w wyniku
metylacji
cytozyny. W DNA niektórych wirusów, np.
bakteriofagów
PBS2, zamiast tyminy występuje
uracyl
, (U), tworząc nukleozyd 2'-deoksyurydynę[1]. 2'-Deoksyurydyna powstaje też w wyniku
deaminacji
C do U.
W skład cząsteczki DNA zwykle wchodzą dwa łańcuchy (DNA dwuniciowy), które biegną antyrównolegle (tzn. koniec jednego jest dokładnie naprzeciw początku drugiego). Łańcuchy owijają się wokół wspólnej osi i tworzą tzw. prawoskrętną
podwójną helisę
. Reszty
cukrowe
i fosforowe, połączone ze sobą
wiązaniem fosfodiestrowym
, znajdują się na zewnątrz helisy, natomiast zasady skierowane są do wnętrza i tworzą
pary zasad
połączone według wzoru:
- A-T (A-U)
- G-C
- T-A (U-A)
- C-G
Zasady połączone są
wiązaniami wodorowymi
. Cząsteczki DNA mogą być bardzo długie. U
Homo sapiens
ich długość (po "rozkręceniu chromosomów") dochodzi w sumie do 2 m, gdzie najdłuższa cząsteczka ma 23 cm. W ścisłym skręceniu DNA do postaci chromosomu biorą udział
białka histonowe
lub niehistonowe.
Każda z nici DNA ma na jednym końcu (oznaczanym jako
koniec 5'
), przy ostatnim nukleotydzie wolną grupę fosforanową przy węglu 5'
deoksyrybozy
, a na drugim końcu (oznaczanym jako
koniec 3'
) ostatni nukleotyd posiada wolną
grupę hydroksylową
przy węglu 3' deoksyrybozy. Ze względu na to, że helisa dwóch nici DNA jest spleciona w ten sposób, że jedna z nici zaczyna się od końca 5' a druga od końca 3', mówi się, że obie nici są względem siebie antyrównoległe.
Łańcuch nici DNA zawiera
informację genetyczną
o kolejności
aminokwasów
w
białkach
kodowaną w postaci
trójek nukleotydowych
odpowiadających odpowiednim aminokwasom podczas
syntezy białka
. Nazywamy to
kodem genetycznym
.
Po "rozpakowaniu" z
chromosomów
, cząsteczka
ludzkiego
DNA miałaby około 180
centymetrów
!
Rodzaje DNA
DNA rozróżnia się pod względem:
- pochodzenia w czasie -
aDNA
- funkcji:
cDNA
, mDNA,
mtDNA
,
chlDNA
, YDNA
- struktury
- jednoniciowy DNA inaczej
ssDNA
- dwuniciowy DNA w formach: A-DNA, B-DNA, C-DNA[2], E-DNA[3], H-DNA[4] P-DNA[5], i Z-DNA[6][7]
- trójniciowy DNA
- czteroniciowy DNA
Najważniejsze z nich przedstawiono w tabeli:
Rodzaj DNA/Funkcja | B-DNA | A-DNA | Z-DNA |
---|
liczba par zasad przypadająca na skręt helisy | 10,4 (ok. 10,2 dla tzw.
wysp CpG
) | 11 | 12 |
kąt skręcania między sąsiednimi parami zasad (w stopniach) | + 34,6 | + 39,0 | - 30,0 |
skok helisy (w
nm
) | 3,54 | 2,53 | 4,56 |
kierunek skręcania | prawoskrętna | prawoskrętna | lewoskrętna |
średnica helisy (w nm) | 2,37 | 2,55 | 1,84 |
Fragment struktury | | | |
Struktura i funkcja DNA są niezależne i mogą występować łącznie lub nie.
Historia poznania
- Ta sekcja jest . Jeśli możesz, .
Za odkrycie w
1953
roku struktury DNA Watson, Crick i Wilkins otrzymali w
1962
Nagrodę Nobla
(Rosalind Franklin zmarła na raka w
1958
).
Przypisy
- ↑ Takahashi and Marmur. 1963. Replacement of thymidylic acid by deoxyuridylic acid in the deoxyribonucleic acid of a transducing phage for Bacillus subtilis. Nature 197:794-795.
- ↑ L van Dam, M H Levitt (2000). "BII nucleotides in the B and C forms of natural-sequence polymeric DNA: A new model for the C form of DNA". J Mol Biol 304 (4): 541-61.
PMID 11099379
.
- ↑ Vargason J.M., Eichman B.F., Ho P.S. 2000. The extended and eccentric E-DNA structure induced by cytosine methylation or bromination. Nature Structural Biology 7:758-761.
- ↑ Wang G., Vasquez K.M. 2006. Non-B DNA structure-induced genetic instability. Mutat Res.: 598, 103-119.
- ↑ Allemand et al. 1998. Stretched and overwound DNA forms a Pauling-like structure with exposed bases. PNAS 24:14152-14157.
- ↑ Ghosh A., Bansal M. 2003. A glossary of DNA structures from A to Z. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 59:620–626.
- ↑ Palecek E. 1991. Local supercoil-stabilized DNA structures. Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 26:151-226.
- ↑
Archiwalne artykuły z Nature z 1953 roku dotyczące odkrycia struktury DNA (dostęp bezpłatny)
. [dostęp 2010-03-05].
Zobacz też
Zagadnienia dotyczące budowy, struktury i funkcji DNA:
Zagadnienia genetyczne:
Eksperymenty:
Inne:
Linki zewnętrzne