Bioinformatyka to dyscyplina zajmująca się stosowaniem narzędzi matematycznych i informatycznych do rozwiązywania problemów z nauk biologicznych . Z bioinformatyką powiązane są: genomika , proteomika , metabolomika i transkryptomika .

Podstawowe zagadnienia bioinformatyki

• katalogowanie informacji biologicznych ( bazy danych , bazy danych sekwencji i wyszukiwanie sekwencji, anotacji, danych numerycznych w bazach danych)
• analiza sekwencji DNA (składanie sekwencji, anotacja, wyszukiwanie sekwencji kodujących, regulatorowych i repetytywnych, motywów, markerów)
• analiza sekwencji genomów , porównywanie genomów
• ustalanie ewolucyjnych relacji pomiędzy zbiorami sekwencji / organizmów ( drzewa filogenetyczne )
• genotypowane (używane między innymi do wyszukiwania genów odpowiedzialnych za choroby genetyczne , w ustalaniu ojcostwa, kryminalistyce )
• analiza ekspresji genów (głównie analiza danych z mikromacierzy )
• analiza sekwencji białek , nazywana też proteomiką (porównywanie sekwencji, wyszukiwanie domen i motywów, przewidywanie własności fizyko-chemicznych, drugo- i trzecio-rzędowej struktury białka, lokalizacji w obrębie komórki, analiza danych z eksperymentow spektroskopwych )
• katagolowanie funkcji genów/białek, analiza dróg metabolicznych (np metabolizm lipidów) oraz dróg sygnałowych (np od receptora na powierzchni komórki poprzez kaskadę kinaz do czynników transkrypcyjnych)
• modelowanie układów biologicznych
• wirtualne dokowanie (ang. virtual docking) - np. używajac trójwymiarowej struktury aktywnego centrum enzymu ("zamek" albo "kieszonka" ang. pocket) przeszukuje się w komputerze tysiace małych cząsteczek z których kilka-kilkanaście ('kluczy') będzie miało kształt mieszczacy się w centrum aktywnym. Pierwszy krok w kierunku odkrywania nowych leków.
• komputery DNA
• morfometria / analiza obrazu

Zobacz też

Studia w Polsce

Studia na specjalności Bioinformatyka zostały uruchomione:

• od roku akademickiego 2003/2004 na studiach dwustopniowych na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu
• od roku akademickiego 2004/2005 jako specjalność bioinformatyka dla studentów informatyki stosowanej na Wydziale Fizyki Astronomii i Informatyki Stosowanej Uniwersytetu Jagiellońskiego
• od roku akademickiego 2004/2005 na Wydziale Farmaceutycznym z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Śląskiego Uniwersytetu Medycznego (kierunek zamknięty - ostatni nabór w roku akademickim 2005/2006)
• od roku akademickiego 2005/2006 jako specjalność bioinformatyka i informatyka chemiczna dla studentów kierunku biotechnologia Politechniki Wrocławskiej (mgr inż.)
• od roku akademickiego 2007/2008 jako specjalność bioinformatyka i biotechnologia farmaceutyczna dla studentów kierunku biotechnologia Politechniki Wrocławskiej (mgr inż.)
• od roku akademickiego 2007/2008 (jako specjalność do wyboru) na studiach magisterskich w Instytucie Informatyki Uniwersytetu Śląskiego
• od roku akademickiego 2005/2006 na Wydziale Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej (studia inżynierskie), z możliwością kontynuacji na poziomie magisterskim
• od roku akademickiego 2008/2009 na studiach dwustopniowych na Wydziale Przyrodniczo-Technicznym Uniwersytetu Opolskiego
• od roku akademickiego 2008/2009 jako makrokierunek Bioinformatyka i Biologia Systemów na Uniwersytecie Warszawskim prowadzony przez Wydział Biologii, Wydział Fizyki oraz Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki.
• od roku akademickiego 2009/2010 na studiach magisterskich w Instytucie Informatyki Uniwersytetu Śląskiego, studia z językiem angielskim jako wykładowym: Modelling and Visualisation in Bioinformatics.
• od roku akademickiego 2009/2010 na studiach inżynierskich w Instytucie Informatyki Uniwersytetu Śląskiego,
• od roku akademickiego 2009/2010 na studiach magisterskich na Wydziale Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu,
• od roku akademickiego 2010/2011 na studiach magisterskich wydziału Biologii i Hodowli Zwierząt Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu