Mitochondrium
MitochondriumMikrofotografia elektronowa dwóch mitochondriów pochodzących z płuca ssaka, pokazująca ich
matriks
oraz błony. Mitochondrium (w liczbie mnogiej mitochondria) – otoczone błoną
organellum
, obecne w większości
komórek eukariotycznych
. Organella te mają różną wielkość, przeważnie od 2 do 8
μm
, mogą też szybko zmieniać swój kształt i rozmiary. Są one miejscem, w którym w wyniku procesu
oddychania komórkowego
powstaje większość
adenozynotrifosforanu
(ATP) komórki, będącego jej źródłem energii[1]. Oprócz tego, mitochondria są zaangażowane w wiele innych procesów, takich jak sygnalizacja komórkowa, specjalizacja, wzrost i
śmierć
komórki, czy też kontrola cyklu komórkowego[2]. Nazwa pochodzi od greckiego μίτος (mitos) - nić oraz χονδρίον (chondrion) - ziarno. Kilka cech mitochondriów czyni je unikalnymi pośród organelli. Ich liczba w pojedynczej komórce jest bardzo różna w zależności od organizmu i typu komórki. Przeciętna komórka eukariotyczna zawiera od kilkuset do kilku tysięcy mitochondriów. Wiele komórek jednakże ma tylko jedno mitochondrium, u kilku zaś, na przykład u ameby Chaos chaos L., stwierdzono po kilka tysięcy mitochondriów[3][4][5]. Nowe mitochondria powstają zwykle poprzez wzrost i podział już istniejących[1]. Organellum to jest złożone z kilku przedziałów, posiadających specyficzne funkcje. Te przedziały to błona zewnętrzna, przestrzeń międzybłonowa, błona wewnętrzna, grzebienie oraz
macierz mitochondrialna
. Białka mitochondrialne mogą być różne, w zależności od komórki i gatunku. W mitochondriach ludzkiego serca zostało zidentyfikowanych 615 różnych rodzajów białek[6], podczas gdy u szczurów liczba ta wynosi 940[7]. Pomimo tego, że większość
genomu
komórki znajduje się w
jądrze komórkowym
, mitochondria, jako jedyne organella poza
plastydami
posiadają własny genom.
Genom mitochondrialny
jest nieduży – koduje tylko od kilkunastu do kilkudziesięciu
białek
z kilkuset białek niezbędnych do funkcjonowania mitochondrium[1]. Co więcej, wykazuje on podobieństwo do genomu
bakterii
[8]. BudowaSchemat mitochondrium zwierzęcego. Mitochondrium składa się z dwóch błon; zewnętrznej i wewnętrznej, zbudowanych z
dwuwarstwy lipidowej
oraz rozmieszczonych w niej
białek
[4]. Są one podobne w budowie do zwykłej błony komórkowej, jednak obydwie błony mają odmienne właściwości. Z powodu takiej budowy, w budowie mitochondrium można wyróżnić pięć odrębnych przedziałów. Są to: błona mitochondrialna zewnętrzna, przestrzeń międzybłonowa (pomiędzu błoną zewnętrzną a wewnętrzną), błona mitochondrialna wewnętrzna, grzebienie mitochondrialne (tworzone przez fałdy błony wewnętrznej) oraz
macierz mitochondrialną
(wewnętrzna przestrzeń mitochondrium)[1]. Błona zewnętrznaBłona zewnętrzna mitochondrium, to błona, która otacza całe
organellum
, oddzielając je od środowiska zewnętrznego. Posiada ona współczynnik
białek
do
lipidów
podobny jak u większości błon komórkowych eukariotów (około 1:1 wagowo). Zawiera duże ilości
białek
zwanych porynami. Poryny są w istocie dużymi (około 2-3 nm średnicy) kanałami, przez które mogą się swobodnie przedostawać wszystkie
białka
o masie mniejszej niż 5000
daltonów
[4]. Białka o większych cząsteczkach mogą pokonać błonę zewnętrzną tylko przy pomocy
transportu aktywnego
. Ich
N-koniec
wiąże się wtedy z podjednostką białka zwanego translokazą błony zewnętrznej, która przenosi je na drugą stronę błony[9]. Małe cząsteczki, na przykład
woda
czy
dwutlenek węgla
mogą swobodnie dyfundować przez tę błonę[1]. Przerwanie błony zewnętrznej skutkuje uwolnieniem do
cytozolu
białek znajdujących się w przestrzeni międzybłonowej, co prowadzi do śmierci komórki[10]. Błona zewnętrzna może łączyć się z
retikulum endoplazmatycznym
, tworząc strukturę zwaną MAM (mitochondria-associated ER-membrane (
ang.
)). Jest to ważne przy wydalaniu przez retikulum
jonów wapnia
oraz pełni rolę przy transporcie
lipidów
z retikulum do mitochondrium[11]. Wśród białek budujących błonę zewnętrzną mitochondrium występują
enzymy
odpowiadające za bardzo rozmaite reakcje, jak np. wydłużanie łańcuchów
kwasów tłuszczowych
, utlenianie
adrenaliny
i rozkład
tryptofanu
. Enzymem markerowym (markerem) błony zewnętrznej jest
oksydaza monoaminowa
(MAO). Przestrzeń międzybłonowaPrzestrzeń międzybłonowa to przestrzeń pomiędzy zewnętrzną a wewnętrzną błoną mitochondrium. Ponieważ błona zewnętrzna jest przepuszczalna dla małych cząsteczek, stężenie substancji takich jak
jony
lub
cukry
w przestrzeni międzybłonowej jest takie same jak w
cytozolu
[4]. Duże
białka
jednak, muszą posiadać specjalne sekwensje sygnałowe aby zostać przetransportowane przez błonę zewnętrzną, ich skład w przestrzeni międzybłonowej jest odmienny od tego, występującego w cytozolu. Jednym z białek charakterystycznych dla tej przestrzeni jest
cytochrom c
[10], zaś jej enzymem markerowym (markerem) jest kinaza adenilanowa. Błona wewnętrznaBłona wewnętrzna mitochondrium, to błona znajdująca się w środku
organellum
. To właśnie w niej zachodzą reakcję chemiczne, przekształcające energię cząsteczek substancji pokarmowych w energię wiązań
ATP
[1]. Ogólnie biorąc, w błonie tej występuje pięć typów
białek
o różnych funkcjach: białka biorące udział w reakcjach
redoks
fosforylacji oksydacyjnej
,
syntaza ATP
wytwarzająca ATP w macierzy mitochondrialnej, specjalne białka kontrolujące przechodzenie metabolitów do oraz z macierzy, białka zajmujące się importem innych białek oraz te, które zajmują się syntezą oraz rozkładem innych białek[4]. W jej skład wchodzi ponad 150
polipeptydów
, posiada także wysoki współczynnik
białek
do
lipidów
(ponad 3:1 wagowo, oznacza to, że 1 białko przypada na 15 fosfolipidów). Są to białka
łańcucha oddechowego
,
syntaza ATP
wytwarzająca ATP w macierzy mitochondrialnej oraz białka transportujące metabolity do wnętrza macierzy i na zewnątrz. Stanowią one około 20% wszystkich białek mitochondrium[4]. Błona wewnętrzna, w przeciwieństwie do błony zewnętrznej nie zawiera poryn i jest nieprzepuszczalna dla wszystkich cząsteczek. Posiada ona jednakże w swojej strukturze nietypowy fosfolipid,
kardiolipinę
. Związek ten, odkryty po raz pierwszy w krowim sercu w 1942, jest charakterystyczny dla błon
bakterii
i mitochondrium[12]. Kardiolipina zawiera w swojej strukturze cztery nasycone kwasy tłuszczowe zamiast dwóch, co może powodować, że nasycona nią błona będzie trudniejsza do spenetrowania[4]. Transport jonów i innych cząsteczek dostających się oraz wychodzących z
macierzy mitochondrialnej
wymaga specjalnych transporterów błonowych. Białka przenoszone są przez kompleks translokazy błony wewnętrznej mitochondrium lub przez Oxa1[9]. Umożliwia to wytworzenie
gradientu protonowego
niezbędnego do działania
łańcucha oddechowego
[1]. GrzebieniePowierzchnia błony wewnętrzna mitochondrium, na przykład w mitochondriach wątroby, jest pięciokrotnie większa od powierzchni zewnętrznej błony mitochondrialnej. Z tego powodu wpukla się ona do środka, tworząc charakterystyczne wpuklenia, tak zwane grzebienie mitochondrialne. Wpuklenia zwiększają powierzchnię błony wewnętrznej, powiększając znacznie obszar, na którym zachodzi produkcja
ATP
. Powierzchnia ta nie jest stała i mitochondria komórek które mają większe zapotrzebowanie na ATP, takie jak komórki
mięśni
, tworzą grzebienie o większej powierzchni. Grzebienie usiane są małymi, okrągłymi ciałami, zwanymi oksysomami. Nie są to wpuklenia przypadkowe, a raczej wytwory błony zewnętrznej, których zadaniem jest kontrolowanie
chemiosmozy
[13]. W grzebieniach zakotwiczone są enzymy
łańcucha oddechowego
. Macierz mitochondrialna
Macierz mitochondrialna
, inaczej matriks, to przestrzeń wewnątrz mitochondrium, ograniczona błoną wewnętrzną. Wypełnia ją rodzaj
żelu
– wodny roztwór białek i
metabolitów
zużywanych na potrzeby mitochondrium. Macierz zawiera około 2/3 wszystkich białek w mitochondrium[4]. W ich skład wchodzą takie białka jak enzymy
β-oksydacji
kwasów tłuszczowych,
cyklu Krebsa
, syntezy
steroidów
i inne. Enzymem markerowym (markerem) matrix mitochondrialnej jest syntetaza cytrynianowa. Macierz zawiera również materiał genetyczny w postaci kilku kopii
mitochondrialnego DNA
(mtDNA),
rybosomy
mitochondrialne i
tRNA
mitochondrialne[4]. Organizacja i występowanieMitochondria występują u prawie wszystkich
eukariotów
. Ich kształt i liczba zmieniają się w zależności od
organizmu
, typu
komórki
oraz jej zapotrzebowania na energię. Pojedyncza komórka zawiera od kilku sztuk do kilku tysięcy mitochondriów, przeciętnie kilkaset. U
organizmów jednokomórkowych
często obecne jest tylko jedno mitochondrium, z drugiej strony, w
komórkach wątroby
ssaków
można znaleźć około 1500 mitochondriów, stanowiących do 1/5 objętości
komórki
[4]. W
komórkach roślinnych
, niezróżnicowanych komórkach zwierzęcych, komórkach regenerujących,
limofcytach
oraz w komórkach
naskórka
występuje po kilkaset tych organelli. Szczególnie dużo, 1-2 tysięcy mitochondriów występuje w komórkach wątrobowych, komórkach gruczołów żołądkowych, kanalików nerkowych krętych i komórkach kory nadnerczy, czy komórkach
mięśnia sercowego
[14]. Mitochondria przyjmują zwykle okrągły lub owalny kształt, istnieją jednak również mitochondria o kształcie niciowatym i rozgałęzionym. Takie formy występują na przykład u jednokomórkowych
wiciowców
,
glonów
i
drożdży
. U zwierząt, obecność form niciowatych stwierdzono w komórkach
trzustki
, wstawce
plemnika
a także w
komórkach wątroby
[14]. Wraz z
cytoszkieletem
, tworzą one rozgałęzioną, trójwymiarową sieć złączonych ze sobą mitochondriów. Takie połączenie może wpływać na przepuszczalność błony zewnętrznej mitochondrium dla
ADP
[15]. Lokalizacja mitochondriów w komórce nie jest stała. W wyniku ruchów
cytoplazmy
lub dzięki związaniu się z elementami cytoszkieletu, mitochondria mają zdolność do przemieszczania się w kierunku miejsca o zwiększonym zapotrzebowaniu na energię. Mogą one lokować się na przykład między
fibrylami komórek mięśniowych
, w aparacie kurczliwym
mięśnia sercowego
, u podstawy komórek nabłonka gruczołowego, w zakończeniach włókien nerwowych -
synapsach
, wzdłuż włókien wrzeciona cytokinetycznego, u podstawy witki w
plemniku
lub w pobliżu substratów oddechowych, takich jak krople tłuszczu[4][14]. FunkcjaNajważniejszymi rolami mitochondriów są wytwarzanie
ATP
poprzez
oddychanie komórkowe
oraz regulacja
metabolizmu komórki
[5]. Główny szereg reakcji
biochemicznych
związany z produkcją ATP, u
eukariotów
zachodzący wyłącznie w mitochondriach, nazywany jest
cyklem kwasu cytrynowego
lub cyklem Krebsa. Są to najważniejsze reakcje mające miejsce w mitochondriach, jednak poza nimi mitochondria pełnią także inne funkcje. Przemiany energetyczneNajważniejszą rolą mitochondrium jest wytwarzanie
ATP
, znajdująca odzwierciedlenie w ilości
białek
błony wewnętrznej mitochondrium, które je przeprowadzają. Zachodzi ono dzięki
utlenianiu
głównych produktów
rozkładu
glukozy
-
pirogronianu
i
NADH
, wytwarzanych w
cytozolu
[5]. Ten proces
oddychania komórkowego
, nazywanego także
oddychaniem tlenowym
, zależny jest od obecności
tlenu
. Kiedy ilość tlenu dostarczanego mitochondriom jest ograniczona, produkty glikolizy przetwarzane są w ramach
oddychania beztlenowego
, procesu który nie zachodzi w mitochondriach[5]. Jest to jednakże proces niekorzystny z energetycznego punktu widzenia, ponieważ podczas oddychania tlenowego uzyskiwane jest około 13 razy więcej energii niż podczas oddychania beztlenowego[16]. Ostatnio zostało dowiedzione, że mitochondria roślinne mogą wytworzyć pewną ilość ATP nawet bez tlenu, stosując jako
substrat
azotyny
[17]. Cykl kwasu cytrynowego
Cząsteczi
pirogronianu
, które powstają w wyniku
glikolizy
są
aktywnie transportowane
poprzez błonę wewnętrzną mitochondrium do macierzy mitochondrialnej, gdzie zostają
utlenione
i połączone z
koenzymem A
tak, by powstał
CO2
,
acetylokoenzym A
oraz
NADH
[5].
Acetylokoenzym A
jest pierwszym substratem
cyklu kwasu cytrynowego
. Enzymy tego cyklu zlokalizowane są głównie w macierzy mitochondrialnej, za wyjątkiem
Dehydrogenazy bursztynianowej
, która umocowana jest w błonie wewnętrznej mitochondrium, gdzie wchodzi w skład kompleksu II[18]. Cykl kwasu cytrynowego utlenia
acetylo-CoA
do dwutlenku węgla a także powoduje powstanie
zredukowanych
kofaktorów: trzech cząsteczek
NADH
i dwóch cząsteczek
FADH2
, stanowiących źródło elektronów dla
łańcucha oddechowego
oraz cząsteczki
GTP
, która od razu przemieniana jest w
ATP
[5]. Łańcuch oddechowy
Potencjał redoks pochodzący od
NADH
i
FADH2
, służący do uzyskania energii podczas utleniania, jest przekazywany
tlenowi
stopniowo, poprzez
łańcuch oddechowy
. Te bogate w energię cząsteczki powstają w macierzy mitochondrialnej podczas cyklu kwasu cytrynowego oraz w
cytoplazmie
komórki
podczas
glikolizy
. Reduktory z cytoplazmy mogą być importowane do mitochondrium przez
antyportowe
czółenko jabłczanowo-asparaginowe lub przy użyciu czółenka glicerofosforanowego[5]. Transport ten przeprowadzają kompleksy białkowe umieszczone w błonie wewnętrznej mitochondrium, takie jak
dehydrogenaza NADH
,
cytochrom bc1
i
oksydaza cytochromu c
. Uzyskana energia używana jest do
pompowania protonów
(H+) do przestrzeni międzybłonowej. Proces ten jest wydajny, jednak pewna część
elektronów
redukuje tlen przedwcześnie, powodując powstanie
reaktywnych form tlenu
, takich jak
ponadtlenki
[5]. Stanowi to przyczynę
stresu oksydacyjnego
oraz może przyczynić się do podupadania funkcji mitochondriów związanego z procesem starzenia się[19]. Kiedy stężenie protonów w przestrzeni międzybłonowej wzrasta, po przeciwnych stronach błony wewnętrznej wytwarza się silny
gradient elektrochemiczny
. Jest on powodowany parciem protonów do powrotu do macierzy mitochondrialnej. Jedyną drogą powrotu jest kompleks białkowy
syntazy ATP
.
Energia potencjalna
przechodzących przez niego protonów używana jest do syntezy
ATP
z
ADP
oraz
anionu
fosforanowego
(Pi)[5]. Proces ten nazywany jest
chemiosmozą
. Produkcja ciepłaW pewnych warunkach,
protony
mogą przedostawać się do macierzy mitochondrialnej nie wytwarzając
ATP
. Proces ten określany jest mianem wyciekaniem protonów bądź mitochondrialne rozprzęgnięcie, zachodzi zaś dzięki
dyfuzji wspomaganej
protonów do macierzy. Powoduje to rozproszenie
energii potencjalnej
gradientu elektrochemicznego
protonów w postaci
ciepła
[5]. Proces przeprowadzany jest dzięki działaniu kanału protonowego, zwanego
termogeniną
lub UCP1[20]. Termogenina jest białkiem o masie 33 k
Da
, odkrytym w 1973 roku[21]. Znajdywana jest głównie w
gruczołach snu zimowego
, zwanych także tłuszczem brunatnym, odpowiedzialnych za produkcję ciepła niezwiązaną z
drżeniem
. Tkanka ta obecna jest u
ssaków
, zwłaszcza u młodych, bądź u gatunków, które odbywają
sen zimowy
. U ludzi, ilość tłuszczu brunatnego największa jest tuż po urodzeniu, potem zaś maleje z wiekiem[20]. Magazynowanie jonów wapniaIlość wolnego
wapnia
w komórce może regulować szereg reakcji oraz jest bardzo ważne dla przewodnictwa sygnałów w komórce. Mitochondria mogą przejściowo magazynować wapń, co stanowi część procesów odpowiedzialnych za zachowanie równowagi wapniowej w komórce[22]. Ich zdolność do szybkiego przyjmowania wapnia w celu późniejszego uwolnienia czyni je dobrymi buforami równowagi wapniowej[23][24][25]. Główną rolę w magazynowaniu wapnia pełni
retikulum endoplazmatyczne
, a między nim a mitochondrium dochodzi do znaczących interakcji pod kątem gospodarki wapniowej[26]. Wapń przechodzi swobodnie przez błonę zewnętrzną mitochondrium do przestrzeni międzybłonowej, skąd transportowany jest do macierzy mitochondrialnej za pomocą
uniportu
wapniowego w błonie wewnętrznej[27]. Transport ten napędzany jest przez
potencjał błonowy
mitochondrium[22]. Uwolnienie wapnia z powrotem do wnętrza komórki może zajść dzięki białku wymiany sodowo wapniowej bądź dzięki ścieżce wapniowo indukowanego uwalniania wapnia[27]. Może to spowodować nagłe lub falowe zmiany
potencjału błonowego
, co może wywołać reakcję w postaci wypuszczenia neurotransmiterów bądź hormonów. Inne funkcjeMitochondria pełnią role także w innych procesach metabolicznych, takich jak: Pochodzenie
Obecnie najszerzej przyjmowany pogląd głosi, że mitochondria są potomkami pewnych organizmów endosymbiotycznych, podobnych do dzisiejszych
bakterii
, które w jakiś sposób przetrwały
endocytozę
do innej komórki i zostały włączone w skład pierwotnych
organizmów eukariotycznych
.Teoria endosymbiozy po raz pierwszy została zaproponowana przez
Konstantina Mereszkowskiego
na początku XX wieku.Pogląd ten został po pewnych zmianach spopularyzowany w latach 70 XX wieku przez Lynn Margulis[28]. Możliwość przeprowadzania tlenowego
oddychania komórkowego
w mitochondriach, dzięki któremu możliwe byłoby uzyskanie większej ilości energii z tej samej ilości pokarmu niż u innych organizmów, stanowiła dużą przewagę ewolucyjną i przyczyniła się do sukcesu ewolucyjnego organizmów posiadających mitochondria. Zwiększyło to także liczbę środowisk, w których takie organizmy mogły się rozwijać. Ocenia się, że do tej endosymbiozy doszło około 2[29]-1,7[30] miliarda lat temu. Mitochondria posiadają wiele cech, które występują także u
prokariotów
. Po pierwsze, mitochondrium zawiera
DNA
, który zorganizowany jest w postaci kilku kopii pojedynczego, kołowego
nukleoidu
, podobnie jak to ma miejsce u prokariotów. Co więcej,
kod genetyczny
mitochondriów jest kodowany w podobny sposób jak to ma miejsce u
proteobakterii
. Także
rybosomy
kodowane przez mitochondrialne DNA przypominają kształtem i wielkością te, które można spotkać u prokariotów[31]. Mają one wielkość 70
S
, taką samą jak rybosomy bakteryjne, nie zaś 80S, jaką mają rybosomy występujące w
cytozolu
komórki eukariotycznej. Świadczy to o tym, że przodkiem mitochondriów był organizm należący do proteobakterii[32]. Niektóre badania sugerują, że należał on do
riketsji
[33], jednak sprawa pochodzenia mitochondriów i ich pokrewieństwa do proteobakterii pozostaje kontrowersyjna[34]. Według innej teorii, mitochondria mogły powstać w tym samym czasie, w którym doszło do wytworzenia błony jądrowej, i mogą być efektem tego samego procesu, który doprowadził do wyodrębnienia jądra komórkowego[34]. Istnieje kilka grup
jednokomórkowych
organizmów eukariotycznych nieposiadających mitochondriów, na przykład
mikrosporydia
, Metamonada, Archamoebae[35]. DziedziczenieU ssaków mitochondria płodu pochodzą wyłącznie z
komórki jajowej
(
plemnik
tworząc
przedjądrze
męskie pozostawia wszystkie swoje organella poza komórką jajową), u wielu innych organizmów (np.
owady
) jednak plemnik wnika do komórki jajowej razem z własnymi mitochondriami. W związku z tym mitochondria dziedziczymy wyłącznie w linii matczynej, "po kądzieli", a geny mitochondrialne nie ulegają rearanżacji przez
rekombinację
. Z tego powodu geny mitochondrialne porównywano dla ustalenia kiedy żyła kobieta, od której pochodzą wszystkie aktualne mitochondria, nazwana niefortunnie przez prasę
Ewą mitochondrialną
, co mylnie sugeruje jedynego przodka wszystkich ludzi. Wyniki wskazują na ok. 200 tysięcy lat i
Afrykę
, z dużym marginesem błędu (kilkadziesiąt tysięcy lat). Wyniki te, podobnie jak wiele innych badań genetycznych, wspierają
hipotezę "Pożegnania z Afryką"
(zob.
Prehistoryczne wędrówki ludzkości
), zgodnie z którą człowiek współczesny wyewoluował w Afryce i stamtąd kolejnymi falami migracji zaludniał Ziemię. Pokazują jednak historię zaledwie jednego fragmentu naszego genomu. Genom
Mitochondria nazywane są autonomicznymi (bądź półautonomicznymi), gdyż są jednymi z niewielu
organelli
, które posiadają własny
genom
(
syntezują
około 10%
białek
). Ludzki genom mitochondrialny to kołowa cząsteczka
DNA
wielkości około 16 tysięcy
par zasad
[36]. Koduje on 37
genów
: 13 odpowiedzialnych za podjednostki kompleksów oddechowych I, III, IV i V, 22 kodujące mitochondrialne
tRNA
oraz dwa odpowiedzialne za
rRNA
[36]. Jedno mitochondrium może zawierać od dwóch do dziesięciu kopii jego DNA[37]. Tak jak u
prokariotów
, w genomie mitochondrialnym występuje proporcjonalnie dużo kodującego DNA w stosunku do obszarów niekodujących oraz brak powtórzeń. Geny mitochondrialne są
transkrybowane
w postaci nici
mRNA
zawierającej kilka genów, która poddawana jest
poliadenylacji
w procesie
obróbki posttranskrypcyjnej
. Nie wszystkie
białka
niezbędne do działania mitochondriów kodowane są przez genom mitochondrialny. Większość z nich kodowana jest przez genom jądrowy, skąd transportowane są do mitochondriów[38]. Dokładna ilość genów kodowanych przez genom jądrowy i mitochondrialny różni się w zależności od
gatunku
. Mitochondrialne DNA zwykle jest kołowe, chociaż zanotowano wyjątki od tej zasady[39]. Ludzkie mitochondrialne DNA pozbawione jest także
intronów
[38], jednakże introny obecne są w genomie mitochondrialnym pewnych innych
eukariontów
[40], na przykład
drożdży
[41] czy
protistów
takich jak Dictyostelium discoideum. U
zwierząt
, genom mitochondrialny jest zwykle pojedynczą, kołową cząsteczką DNA o wielkości 16 tysięcy par zasad, zawierająca 37 genów. Jednym z ciekawszych wyjątków jest genom mitochondrialny
wszy ludzkiej
. Jest on zorganizowany w postaci osiemnastu kołowych cząsteczek DNA, z których każda ma wielkość od trzech do czterech tysięcy par zasad i zawiera od jednego do trzech genów[42]. Stwierdzono, że pomiędzy tymi cząsteczkami dochodzi do
rekombinacji genetycznej
. O ile drobne różnice w odczytywaniu standardowego kodu genetycznego zostały przewidziane wcześniej[43], żadne nie zostały odkryte do 1979 roku, kiedy to uczeni badający ludzki genom mitochondrialny odkryli, że stosuje on inne od standardowego kodowanie[44]. Od tamtej pory odkryto wiele takich drobnych różnic[45], w tym także różne rodzaje kodowania w genomach mitochondrialnych[46]. Różnice kodowania genomu mitochondrialnego w porównaniu do kodowania standardowego[4]Organizm | Kodon | Kodowanie standardowe | Kodowanie w mitochondriach |
---|
Ssaki | AGA, AGG | Arginina | Kodon stop | AUA | Izoleucyna | Metionina | UGA | Kodon stop | Tryptofan | Bezkręgowce | AGA, AGG | Arginina | Seryna | AUA | Izoleucyna | Metionina | UGA | Kodon stop | Tryptofan | Drożdże | AUA | Izoleucyna | Metionina | UGA | Kodon stop | Tryptofan | CUA | Leucyna | Treonina | Mutacje w genach mitochondrialnych powodują
choroby mitochondrialne
, których objawy dotykają głównie tkanki o największym zapotrzebowaniu energetycznym - mięśniową i nerwową. Choroby te mają charakterystyczny, matczyny wzór dziedziczenia. Również mutacje kodowanych w jądrze komórkowym białek mitochondrialnych powodują
choroby genetyczne
(np.
ataksja Friedreicha
).
Mitochondrialny DNA
jest narażony na uszkodzenia przez
wolne rodniki
z
łańcucha oddechowego
, a w mitochondriach nie ma sprawnych mechanizmów naprawczych dla DNA. Leży to u podłoża hipotezy tłumaczącej objawy starzenia się akumulacją mutacji somatycznych mitochondrialnego DNA i obniżaniem sprawności energetycznej komórek. Tak zwany obszar hiperzmienny mitochondrialnego DNA to niekodujący fragment genomu mitochondrialnego, który bardzo się różni między ludźmi. Dlatego wykorzystuje się go do badań
genetyki populacyjnej
oraz w medycynie sądowej do ustalania tożsamości. Sekwencje niektórych genów mitochondrialnych, różniące się między gatunkami, mogą służyć jako "kod kreskowy" charakterystyczny dla poszczególnych gatunków i są w związku z tym wykorzystywane w badaniach
bioróżnorodności
. Ponieważ komórka zawiera tysiące kopii mitochondrialnego DNA, ma on większą szansę niż DNA jądrowy zachować się w materiale kopalnym. Do niedawna jedyne znane sekwencje
kopalnego DNA
były sekwencjami mitochondrialnymi. Porównanie sekwencji DNA mitochondrialnego ludzi współczesnych i
neandertalczyków
sugeruje, że gatunki te nie krzyżowały się. Zobacz teżPrzypisy- ↑ 1,0 1,1 1,2 1,3 1,4 1,5 1,6 Organizacja komórki. W: Eldra P. Solomon, Linda R. Berg, Diana W. Martin: Biologia. Warszawa: MULTICO Oficyna Wydawnicza, 2007. .
OCLC
177294444
.
- ↑ Heidi M. McBride, Margaret Neuspiel, Sylwia Wasiak.
Mitochondria: More Than Just a Powerhouse
. „Current Biology”. 16 (14). Elsevier Science.
doi:10.1016/j.cub.2006.06.054
.
ISSN
1879-0445
.
OCLC
45113007
(
ang.
).
- ↑ Immo E. Scheffler: Mitochondria. New York: Wiley, 1999. .
- ↑ 4,00 4,01 4,02 4,03 4,04 4,05 4,06 4,07 4,08 4,09 4,10 4,11 Alberts, Bruce; Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter: Molecular Biology of the Cell. Nowy Jork: Garland Publishing Inc., 1994. ..
- ↑ 5,00 5,01 5,02 5,03 5,04 5,05 5,06 5,07 5,08 5,09 5,10 Voet, Donald; Judith G. Voet, Charlotte W. Pratt: Fundamentals of Biochemistry, 2nd Edition. John Wiley and Sons, Inc., 2006, s. 547. .
- ↑ Steven W. Taylor, Eoin Fahy, Bing Zhang, Gary M. Glenn, Dale E. Warnock, Sandra Wiley, Anne N. Murphy, Sara P. Gaucher, Roderick A. Capaldi, Bradford W. Gibson, Soumitra S. Ghosh.
Characterization of the human heart mitochondrial proteome
. „Nature Biotechnology”. 21, ss. 281 - 286 (2003-02-18). Nature America, Inc..
doi:10.1038/nbt793
.
ISSN
1546-1696
.
OCLC
42019113
(
ang.
).
- ↑ Jun Zhang, Xiaohai Li, Michael Mueller, Yueju Wang, Chenggong Zong, Ning Deng, Thomas M. Vondriska, David A. Liem, Jeong-In Yang, Paavo Korge, Henry Honda, James N. Weiss, Rolf Apweiler, Peipei Ping.
Systematic characterization of the murine mitochondrial proteome using functionally validated cardiac mitochondria
. „Proteomics”. 8 (8) (2008-03-18). WILEY-VCH Verlag.
doi:10.1002/pmic.200700851
.
ISSN
1615-9861
.
OCLC
47059548
(
ang.
).
- ↑ Siv G. E. Andersson, Olof Karlberg, Björn Canbäck, Charles G Kurland.
On the origin of mitochondria: a genomics perspective.
. „Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci.”, ss. 165–179 (2003-01-29).
doi:10.1098/rstb.2002.1193.
(
ang.
).
- ↑ 9,0 9,1 Herrmann JM, Neupert W.
Protein transport into mitochondria
. „Curr Opin Microbiol” (4 kwietnia 2000).
doi:10.1016/S1369-5274(00)00077-1
(
ang.
).
- ↑ 10,0 10,1 Chipuk J .E., Bouchier-Hayes L., Green D. R..
Mitochondrial outer membrane permeabilization during apoptosis: the innocent bystander scenario
. „Cell Death and Differentiation”. 13 (19 maja 2006).
doi:10.1038/sj.cdd.4401963
.
- ↑ Teruo Hayashi, Rosario Rizzuto, Gyorgy Hajnoczky,Tsung-Ping Su.
MAM: more than just a housekeeper
. „Trends in Cell Biology”. 19 (2), ss. 81-88 (12 stycznia 2009).
doi:10.1016/j.tcb.2008.12.002.
(
ang.
).
- ↑ Jeanie B. McMillina, William Dowhan.
Cardiolipin and apoptosis
. „Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids”. 1585 (2-3), ss. 97-107 (2002-12-05).
doi:10.1016/S1388-1981(02)00329-3
(
ang.
).
- ↑ Carmen A. Mannella.
Structure and dynamics of the mitochondrial inner membrane cristae
. „Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research”. 1763 (5-6), ss. 542-548 (2006-04-20).
doi:10.1016/j.bbamcr.2006.04.006
(
ang.
).
- ↑ 14,0 14,1 14,2
Mitochondrium - Instytut Biologii Akademii Podlaskiej
(
pol.
). [dostęp 2010-06-07].
- ↑ L. Rappaport, P. Oliviero, J.L. Samuel.
Cytoskeleton and mitochondrial morphology and function
. „Molecular and Cellular Biochemistry”. 184 (1-2), ss. 101-105. Springer Netherlands.
doi:10.1023/A:1006843113166
.
ISSN
1573-4919
(
ang.
).
- ↑ P. R. Rich.
The molecular machinery of Keilin's respiratory chain
. „Biochem Soc Trans.”.
doi:10.1042/BST0311095
(
ang.
).
- ↑ Maria Stoimenova, Abir U. Igamberdiev, Kapuganti Jagadis Gupta, Robert D. Hill.
Nitrite-driven anaerobic ATP synthesis in barley and rice root mitochondria
. „Planta”. 226 (2), ss. 465-474. Springer Berlin / Heidelberg.
doi:10.1007/s00425-007-0496-0
.
ISSN
1432-2048
(
ang.
).
- ↑ A. King, M. A. Selak, E. Gottlieb. Succinate dehydrogenase and fumarate hydratase: linking mitochondrial dysfunction and cancer. „Oncogene”. 4675–4682 (25) (2006).
doi:10.1038/sj.onc.1209594
(
ang.
).
- ↑ Hai Huang, Kenneth G Manton.
The role of oxidative damage in mitochondria during aging: A review
. „Frontiers in Bioscience”. 1100-1117 (9) (2004-05-01).
doi:10.2741/1298
(
ang.
).
- ↑ 20,0 20,1 Julien Mozo, Yalin Emre, Frederic Bouillaud, Daniel Ricquier, Francois Criscuolo.
Thermoregulation: What Role for UCPs in Mammals and Birds?
. „Bioscience Reports”. 227–249 (25) (2005).
doi:10.1007/s10540-005-2887-4
(
ang.
).
- ↑ David G. Nicholls, Olov Lindberg.
Brown-adipose-tissue mitochondria. The influence of albumin and nucleotides on passive ion permeabilities
. „European Journal of Biochemistry”. 37 (3), ss. 523 - 530 (2005-03-03).
doi:10.1111/j.1432-1033.1973.tb03014.x
(
ang.
).
- ↑ 22,0 22,1 George J. Siegel: Basic neurochemistry : molecular, cellular, and medical aspects. Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkins, 1999. 9780397518203.
OCLC
39013748
.
- ↑ Michel F. Rossier.
T channels and steroid biosynthesis: in search of a link with mitochondria
. „Cell Calcium”. 40 (2), ss. 155-164 (2006-06-08).
doi:10.1016/j.ceca.2006.04.020
(
ang.
).
- ↑ Carl T Brighton, Robert M. Hunt. Mitochondrial calcium and its role in calcification. „Clinical Orthopaedics and Related Research”. 100, ss. 406-416 (1974) (
ang.
).
- ↑ Carl T Brighton, Robert M. Hunt. The role of mitochondria in growth plate calcification as demonstrated in a rachitic model. „Journal of Bone and Joint Surgery”. 60-A, ss. 630-639 (1978) (
ang.
).
- ↑ Paola Pizzo, Tullio Pozzan.
Mitochondria–endoplasmic reticulum choreography: structure and signaling dynamics
. „Trends in Cell Biology”. 10 (17), ss. 511-517 (2007-10).
doi:10.1016/j.tcb.2007.07.011
(
ang.
).
- ↑ 27,0 27,1 Richard J. Miller.
Mitochondria – the kraken wakes!
. „Trends in Neurosciences”. 21 (3), ss. 95-97 (1998-03-01).
doi:10.1016/S0166-2236(97)01206-X
(
ang.
).
- ↑ Lynn Sagan. On the origin of mitosing cells. „Journal of Theoretical Biology”. 14 (3), ss. 225-274 (1967-03).
doi:10.1016/0022-5193(67)90079-3
(
ang.
).
- ↑ Da-Fei Feng, Glen Cho, Russell F. Doolittle. Determining divergence times with a protein clock: Update and reevaluation. „PNAS”. 94 (24) (1997-11-25).
doi:10.1073/pnas.94.24.13028
(
ang.
).
- ↑ Victor V. Emelyanov. Rickettsiaceae, Rickettsia-Like Endosymbionts, and the Origin of Mitochondria. „Bioscience Reports”. 21, ss. 1-17 (2001).
doi:10.1023/A:1010409415723.
(
ang.
).
- ↑ Thomas W. O'Brien. Properties of Human Mitochondrial Ribosomes. „IUBMB Life”. 55 (9), ss. 505 - 513 (2008-01-03).
doi:10.1080/15216540310001626610
(
ang.
).
- ↑ Douglas J. Futuyma. On Darwin's Shoulders. „Natural History”. 114 (9), ss. 64–68 (2005).
- ↑ Victor V. Emelyanov. Mitochondrial connection to the origin of the eukaryotic cell. „European Journal of Biochemistry”. 270 (9), ss. 1599 - 1618 (2003-03-11).
doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03499.x
(
ang.
).
- ↑ 34,0 34,1 Michael W. Gray, Gertraud Burger, B. Franz Lang. Mitochondrial Evolution. „Science”. 283, ss. 1476 - 1481 (1999-03-05).
doi:10.1126/science.283.5407.1476
(
ang.
).
- ↑ T. Cavalier-Smith. Archamoebae: the ancestral eukaryotes?. „Biosystems”. 25 (1-2), ss. 25-38 (1991).
doi:10.1016/0303-2647(91)90010-I
(
ang.
).
- ↑ 36,0 36,1 David C. Chan. Mitochondria: Dynamic Organelles in Disease, Aging, and Development. „Cell”. 125 (7), ss. 1241-1252 (2006-06-30).
doi:10.1016/j.cell.2006.06.010
(
ang.
).
- ↑ Rudolf J. Wiesner, J. Caspar Rüegg, Ingo Morano. Counting target molecules by exponential polymerase chain reaction: Copy number of mitochondrial DNA in rat tissues. „Biochemical and Biophysical Research Communications”. 183 (2), ss. 553-559 (1992-03-16).
doi:10.1016/0006-291X(92)90517-O
(
ang.
).
- ↑ 38,0 38,1 S. Anderson A. T. Bankier B. G. Barrell M. H. L. de Bruijn A. R. Coulson J. Drouin I. C. Eperon D. P. Nierlich B. A. Roe F. Sanger P. H. Schreier A. J. H. Smith R. Staden & I. G. Young. Sequence and organization of the human mitochondrial genome. „Nature”. 290, ss. 457 - 465 (1981).
doi:10.1038/290457a0
(
ang.
).
- ↑ H. Fukuhara, F. Sor, R. Drissi, N. Dinouël i inni. Linear mitochondrial DNAs of yeasts: frequency of occurrence and general features.. „Mol Cell Biol”. 13 (4), ss. 2309-14 (Apr 1993).
PMID 8455612
.
- ↑ Giorgio Bernardi. Intervening sequences in the mitochondrial genome. „Nature”. 276, ss. 558 - 559 (1978).
doi:10.1038/276558a0
.
- ↑ Sharda K. Hebbar, Scott M. Belcher, Philip S. Perlman. A maturase-encoding group MA intron of yeast mitochondria self-splices in vitro. „Molecular Biology”. 20 (7), ss. 1747-1754 (1992).
doi:10.1093/nar/20.7.1747
(
ang.
).
- ↑ Renfu Shao, Ewen F. Kirkness, Stephen C. Barker1,3.
The single mitochondrial chromosome typical of animals has evolved into 18 minichromosomes in the human body louse, Pediculus humanus
. „Genome Research”. 19 (5), ss. 904-912 (2008-12-24).
doi:10.1101/gr.083188.108.
(
ang.
).
- ↑ Crick, F. H. C., Orgel, L. E. (1973) "Directed panspermia." Icarus 19:341-346. s. 344: "It is a little surprising that organisms with somewhat different codes do not coexist."
- ↑ B. G. Barrell, A. T. Bankier, J. Drouin. A different genetic code in human mitochondria. „Nature”. 282, ss. 189-194 (1797-11-08).
doi:10.1038/282189a0
(
ang.
).
- ↑ Andrzej Elzanowski, Jim Ostell:
The Genetic Codes
(
ang.
). National Center for Biotechnology Information, 2008-04-07. [dostęp 2010-06-21].
- ↑ T. H. Jukes, S. Osawa. The genetic code in mitochondria and chloroplasts. „Cellular and Molecular Life Sciences”. 46 (11-12), ss. 1117-1126 (1990-12). Birkhäuser Basel.
doi:10.1007/BF01936921
.
ISSN
1420-682X
(
ang.
).
Bibliografia- Eldra P. Solomon, Linda R. Berg, Diana W. Martin: Biologia. Warszawa: MULTICO Oficyna Wydawnicza, 2007. .
OCLC
177294444
.
Linki zewnętrzne
Inne hasła zawierające informacje o "Mitochondrium":
Oddychanie komórkowe
...
Organellum
...
Cykl kwasu cytrynowego
...
Łańcuch oddechowy
...
Fosforylacja oksydacyjna
...
Glikoliza
...
Koenzym A
...
Historia Ziemi
...
Genom
...
Chromosom
...
Inne lekcje zawierające informacje o "Mitochondrium":
Budowa i rola części czynnej układu ruchu (plansza 4)
...
Komórka (plansza 20)
e height=380 width=770 >
Mitochondrium
Każde Mitochondrium otoczone jest dwiema błonami lipidowo – białkowymi. Błona zewnętrzna jest ...
Budowa i rola części czynnej układu ruchu (plansza 6)
...
|